Dieciseisavos de final (14/15 y 22 febrero de 2007):
Zulte Waregem - Newcastle
Braga - Parma
Lens - Panathinaikos
Leverkusen - Blackburn Rivers
Hapoel Tel Aviv - Rangers
Livorno - RCD Espanyol
Feyenoord - Tottenham
Fenerbahce - AZ
Werder Bremen - Ajax
Spartak Moscú - Celta de Vigo
CSKA Moscú - M.Haifa
AEK Atenas - PSG
Benfica - Dinamo de Bucarest
Steaua Bucarest - Sevilla
Shakhtar Donestk - Nancy
Girondins - Osasuna
Octavos de final(3 y 4 de abril de 2007 -ida- y el 10 y 11 -vuelta-)
Zulte Newcastle vs Fenerbahce - AZ
CSKA Moscú-Maccabi vs Livorno-Espanyol
Happoel-Glasgow vs Girondins-Osasuna
Braga-Parma vs Feyenoord-Tottenham
Steaua-Sevilla vs Shaktar-Nancy
Lens-Panathinaikos vs Leverkusen-Blackburn
AEK-PSG vs Benfica-Dinamo
Spartak-Celta vs Bremen-Ajax